2009年4月30日世界卫生组织、联合国粮农组织和世界动物卫生组织宣布，一致同意使用A（H1N1）型流感指代当时疫情，并不再使用“猪流感”一词。中国卫生部门则相继将原人感染猪流感改称为甲型H1N1流感。中国卫生部2009年4月30日发布2009年第8号公告，明确将甲型H1N1流感（原称人感染猪流感）纳入传染病防治法规定管理的乙类传染病，并采取甲类传染病的预防、控制措施。传染病防治法规定管理的传染病分为甲类、乙类和丙类。其中甲类是后果严重传染性最强的传染病，依次递减。甲类传染病包括鼠疫和霍乱。乙类传染病包括传染性非典型肺炎、艾滋病、病毒性肝炎等20余种；丙类传染病包括流行性感冒、手足口病等10余种。世界卫生组织已开始使用“Ａ（Ｈ１Ｎ１）型流感”代替“猪流感”来指代当前疫情，我国卫生部公告中则将这一疾病称为“甲型Ｈ１Ｎ１流感”。对此，中国疾控中心副主任杨维中１日告诉记者，“甲型”即“Ａ型”，我国这一名称与国际的名称其实是一回事，只是按国内中文表述的惯例称为“甲型”。
导致这次墨西哥和美国等发生疫情的病毒为Ａ型流感病毒，Ｈ１Ｎ１亚型猪流感病毒毒株，该毒株包含有猪流感、禽流感和人流感三种流感病毒的基因片断，是一种新型猪流感病毒，可以人传染人。 世卫组织多次表明，虽然这种新型病毒是由猪流感病毒演变而来，但到目前为止这种病毒只是使人患病，还没有发现猪被感染的病例。 世卫组织宣布从４月３０日起，开始使用“Ａ（Ｈ１Ｎ１）型流感”而非“猪流感”来指代当前疫情。世卫组织发言人汤普森说，之所以更改当前疫情的叫法，是因为“猪流感”一词容易误导消费者，农业界和联合国粮农组织已就此表达关切。 流感病毒有三种类型：甲型（Ａ型）流感病毒感染哺乳动物以及鸟类；乙型（Ｂ型）流感病毒只感染人类，疾病的产生通常较甲型病毒温和；丙型（Ｃ型）流感病毒只感染人类，并不会引起严重的疾病。
